Если обратиться к русским диалектам и некоторым другим славянским наречиям, то чередование юсов в прятать - прут (prentati - pront) легко объясняется. Первоначальные значения связаны с значением "корчевать пни, рыться в золе при подсечно-огневом земледелии" и "обдирать ветки, очищать от сучков", т.е. значение оголения дерева. Но от "рыхлить" и "искать что-то в золе" прямой переход к "скрывать, прятать".