Есть такая проблема в истории, "нумидийская загадка". Уже греки и римляне не могли понять, почему среди берберов так много голубоглазых и светловолосых. Потом появились теории об атлантах и проч.

Если четко отделять достоверно научное знание о народах Сахары от бреда, который иногда перепощивает Карпец, то что мы имеем?
Гаплогруппа - это показатель лишь по прямой мужской линии, это не показатель общего родства или цвета кожи и глаз. Е1 - гаплогруппа как раз местная, сформировавшаяся в Северной Африке.
Известно, что берберы заселили Сахару в эпоху неолита, придя с Ближнего Востока. До этого здесь тоже были культуры в эпоху, когда Сахара была влажным лесом, но остались ли гены того населения - большой вопрос. Никакого особого до-берберского субстрата в берберских языках вроде бы нет.

Гуанчи на Канарах - единственные, про кого достоверно известно, что это были потомки исконного древнейшего "атлантического" населения, смешавшиеся с берберами и отчасти усвоившими их язык и письменность.